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Nature 子刊 | HER2-low 和 HER2-0 乳腺癌的基因组表征分析,暂不支持HER2-low作为独立分型

作者:肿瘤瞭望   日期:2023/12/21 14:15:55  浏览量:5596

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目前,HER2-low和HER2-0(IHC 0)乳腺癌的分子基础仍然不明确。随着抗HER2治疗的抗体偶联药物(ADC)的发展,临床对HER2-low和HER2-0准确区分的需求更高。虽然HER2-low与HER2-0乳腺癌具有不同的基因组基础,但目前对HER2-low是否应该被作为独特的分子分型无定论1 2。2023年11月,《Nature Communication》发布了一项针对HER2-low和HER2-0基因组表征探索的临床研究,研究者通过对丹娜·法伯(Dana-Farber)癌症研究所大量晚期乳腺癌(mBC)患者的HER2-low与HER2-0基因组图谱展开了详细的分析、对比和描述。

编者按:目前,HER2-low和HER2-0(IHC 0)乳腺癌的分子基础仍然不明确。随着抗HER2治疗的抗体偶联药物(ADC)的发展,临床对HER2-low和HER2-0准确区分的需求更高。虽然HER2-low与HER2-0乳腺癌具有不同的基因组基础,但目前对HER2-low是否应该被作为独特的分子分型无定论1 2。2023年11月,《Nature Communication》发布了一项针对HER2-low和HER2-0基因组表征探索的临床研究,研究者通过对丹娜·法伯(Dana-Farber)癌症研究所大量晚期乳腺癌(mBC)患者的HER2-low与HER2-0基因组图谱展开了详细的分析、对比和描述。
 
研究方法
 
本研究纳入在丹娜·法伯癌症研究所前瞻性研究数据库中2013年7月1日至2020年12月31日mBC临床病理数据。入选患者为初治或复发的mBC患者,并根据美国临床肿瘤学会/美国病学学会(ASCO/CAP)标准确诊为HER2阴性患者;若无法检索到患者的免疫组化(IHC)信息、或存在IHC2+但无原位杂交(ISH)信息、或HER2阳性则均需排除。对上述所有mBC患者二代基因测序(NGS)的信息予以分析对比,并描述HER2-low和HER2-0的基因特征。

队列特征
 
本研究纳入1039例符合标准的患者,其中487例患者在NGS检测为HER2-low(46.9%),552例患者为HER2-0(53.1%);706例(67.9%)患者为雌激素受体阳性(ER+),39例(3.8%)为ER低表达(ER-low),288例(27.7%)为ER阴性(ER-),6例(0.6%)无ER数据。HER2-low与HER2-0样本之间ER分布存在显著差异:ER+亚组中,HER2-low vs HER2-0为370个(76.0%)vs 336个(60.9%);ER-low亚组中,HER2-low vs HER2-0为18个(3.7%)vs 21个(3.8%);ER-亚组中,HER2-low vs HER2-0为94个(19.3%)vs 194个(35.1%),p=1.29e-7。此外,在从初始诊断到NGS检测的时间、脑转移发生率、肝转移发生率、既往接受内分泌治疗方面均存在差异(均p<0.05)(图1)。
 
图1队列特征
 
HER2-low和HER2-0乳腺癌基因组蓝图
 
在HER2-low队列中,最常见的致癌突变是TP53(34.8%)、PIK3CA(32.9%)、CDH1(15.3%)、GATA3(13.5%)和ESR1(10.8%)(图1和2)。在HER2-0队列中,最常见的致癌突变同样为TP53(50.3%)、PIK3CA(32.2%)、CDH1(11.8%)、GATA3(8.0%)和ESR1(7.1%)。在HER2-low和HER2-0队列中,超过5%的病例中仅存在3种致癌拷贝数变异(CNVs),包括:CCND1高扩增(HER2-low 13.3%,HER2-0 13.2%)、FGFR1高扩增(HER2-low 12.3%,HER2-0 9.8%)和MYC高扩增(HER2-low 6.1%,HER2-0 6.1%)(图2和图3)。
 
图2不同HER2状态的基因突变状况
 
图3 OncoPrint viewe下HER2-low和HER2-0 BC的基因蓝图
 
HER2-low和HER2-0的基因组图谱对比
 
研究者对比了HER2-low和HER2-0的基因组图谱。Logistic回归用于解释背景突变或拷贝数突变率以及矫正ER状态。常见突变(在HER2-0或HER2-low样本中均&gt;4%)分析显示,在HER2-low样本中主要为MTOR突变(比值比[OR]=1.95;95%CI,1.04-3.64;p=0.04),在HER2-0样本中则主要包括MAP3K1突变(OR=0.59;95%CI,0.40-1.00,p=0.03)、NF1致癌突变(OR=0.48;95%CI:0.24-0.97;p=0.04)、TP53致癌突变(OR=0.72;95%CI,0.53–0.97;p=0.03)。然而经矫正的多重假设检验分析显示,HER2-low和HER2-0之间的基因突变分布没有差异。在致癌CNV分析方面,仅显示HER2-low中ESR1扩增(OR=4.89,95%CI 1.02–23.13,p=0.05)和IGF1R扩增(OR=2.539,95%CI 1.00–6.40,p=0.05)富集,HER2-low和HER2-0中的致癌CNV并未改变(图4)。
 
图4 HER2-low和HER2-0基因突变丰度分析
 
肿瘤突变负荷(TMB)
 
HER2-low和HER2-0的TMB之间无显著差异,中位TMB为7.26(0.76-85.94)vs 7.60(0.00-111.36),p=0.24;按ER状态分层p=0.28,Kruskal-Wallis检验)。总体而言,7.1%的HER2-0和6.6%的HER2-low为高突变的(P=0.86)。
 
ERBB2拷贝数
 
786个样本可评估ERBB2拷贝数(HER2-low 369个,HER2-0 417个)。HER2-low与HER2-0对比,ERBB2单拷贝缺失为56个(15.2%)vs 128个(30.7%),无变化为247个(66.9%)vs 252个(60.4%),等位基因增加为66例(17.9%)vs 37例(8.9%),在考虑ER状态后,分布差异有统计学意义(HER2-low中位拷贝数2.05,HER2-0中位拷贝数1.79,p=2.36e-6,使用ER状态作为分层的Cochran-Mantel-Haenszel[CMH]检验)。在考虑HER2 IHC时,与ER状态结果相似(IHC 0中位拷贝数1.79,IHC 1+中位拷贝数2.02,IHC 2+中位拷贝数2.08,P=4.11e-6,使用ER状态作为分层的CMH检验)(图5)。
 
图5 HER2-low和HER2-0的ERBB2拷贝数比较
 
转移性乳腺癌样本的敏感性分析
 
801例已知ER状态的转移性乳腺癌患者样本纳入敏感性分析(HER2-low 385个,HER2-0 416个)。与总体分析一致,HER2-low呈现ER+可能性更高(HER2-low vs HER2-0为78.7%vs 63.2%,p=2.87e-6)。HER2-low和HER2-0的前5位突变基因为TP53、PIK3CA、CDH1、ESR1和GATA3,与总体分析的突变率相当。CNV也与总体分析一致,CCND1、FGFR1和MYC扩增最为常见。CNV、TMB也无显著差异。ERBB2基因组拷贝数方面,HER2-low和IHC表达均与ERBB2拷贝数显著相关,HER2-low vs HER2-0单拷贝缺失为13.0%vs 32.3%,无变化为68.7%vs 60.8%,等位基因增加为18.3%vs 6.9%。当校正ER状态后,发现HER2-low(p=1.42e-7)、HER2 IHC评分均与ERBB2拷贝数显著相关(p=5.53e-6)。
 
IHC 2+与IHC 0的敏感性分析
 
该队列分析工759个样本,其中549个为HER2-0,210个为HER2-low(HER2 IHC2+/ISH-)。ER阳性表现的以HER2 IHC 2+样本居多(78.1%,p=5.86e-6<0.001),两组之间的TMB无显著差异,mTMB HER2 IHC 2+vs HER2-0为7.26(0.76–38.02)vs 7.60,HER2-0(0.0–111.36),p=0.86。HER2 IHC 2+队列中常见的致癌基因组突变与整体分析相似,为:PIK3CA(36.2%)、TP53(32.9%)、CDH1(14.8%)、GATA3(13.8%)和ESR1(11.4%),其中PIK3CA取代TP53成为了该人群最常见的突变。
 
总结
 
通过对HER2-low和HER2-0之间基因特征比较显示,HER2-low较HER2-0的ERBB2等位基因拷贝数增加的比例更高,HER2-0的ERBB2单拷贝缺失的比例更高。总体而言,HER2-low和HER2-0肿瘤的基因组蓝图没有显著差异,且HER2-low和HER2-0乳腺癌之间分子相似性特点似乎也支持了二者均可能从抗HER2 ADC的治疗中获益。基于本研究HER2-low和HER2-0分子特征整体相似的观点,故不应将HER2-low视为乳腺癌的独特分子亚型,而应将其作为一组异质性肿瘤用于辅助治疗决策。
 
声明:材料由阿斯利康支持,仅供医疗卫生专业人士参考。
 
文献来源:
 
Tarantino P,Gupta H,Hughes ME,et al.Comprehensive genomic characterization of HER2-low and HER2-0 breast cancer[published correction appears in Nat Commun.2023 Dec 14;14(1):8321].Nat Commun.2023;14(1):7496.Published 2023 Nov 18.doi:10.1038/s41467-023-43324-w
 
参考文献:
 
1 Tarantino P,Viale G,Press MF,Hu X,Penault-Llorca F,Bardia A,Batistatou A,Burstein HJ,Carey LA,Cortes J,Denkert C,Diéras V,Jacot W,Koutras AK,Lebeau A,Loibl S,Modi S,Mosele MF,Provenzano E,Pruneri G,Reis-Filho JS,Rojo F,Salgado R,Schmid P,Schnitt SJ,Tolaney SM,Trapani D,Vincent-Salomon A,Wolff AC,Pentheroudakis G,AndréF,Curigliano G.ESMO expert consensus statements(ECS)on the definition,diagnosis,and management of HER2-low breast cancer.Ann Oncol.2023 Aug;34(8):645-659.doi:10.1016/j.annonc.2023.05.008.Epub 2023 Jun 1.PMID:37269905.
 
2 Viale G,Basik M,Niikura N,Tokunaga E,Brucker S,Penault-Llorca F,Hayashi N,Sohn J,Teixeira de Sousa R,Brufsky AM,O’Brien CS,Schmitt F,Higgins G,Varghese D,James GD,Moh A,Livingston A,de Giorgio-Miller V.Retrospective study to estimate the prevalence and describe the clinicopathological characteristics,treatments received,and outcomes of HER2-low breast cancer.ESMO Open.2023 Aug;8(4):101615.doi:10.1016/j.esmoop.2023.101615.Epub 2023 Aug 8.PMID:37562195;PMCID:PMC10515285.
 
审批编号CN-126928,有效期至2024-12-17
声明:本材料由阿斯利康支持,仅供医疗卫生专业人士参考

 

版面编辑:张靖璇  责任编辑:无医学编辑

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