最近一项新的研究发现，转移性肿瘤比早期肿瘤携带更多的基因突变。这就意味着，要使精准医学在肿瘤领域中成为现实，则需要一种比大多数商业检测更详细、更实时全面的方法来检测转移性肿瘤及其序列。
最近一项新的研究发现，转移性肿瘤比早期肿瘤携带更多的基因突变。这就意味着，要使精准医学在肿瘤领域中成为现实，则需要一种比大多数商业检测更详细、更实时全面的方法来检测转移性肿瘤及其序列。
密歇根大学综合癌症中心的研究人员进行了一项迄今为止最大最全面的检测晚期肿瘤遗传和分子学信息的研究，对500例转移性肿瘤患者的DNA和RNA同时进行了测序，其结果发表在NATURE杂志上。
这项研究的特色在于：一、研究人员获取了大多数患者的新鲜活检，从肿瘤转移灶中提取样本，而不是原发性肿瘤；二、同时对DNA和RNA进行了测序；三、将癌组织与患者的正常DNA进行比较。
这项密歇根肿瘤学测序计划启动于2010年，共入组了500例实体瘤患者，并对转移性肿瘤和正常组织的DNA和RNA都进行测序，以确定可能有助于推动肿瘤治疗的突变。该计划还成立了肿瘤精准医疗委员会，组织专家对每个病例进行讨论。Mi-ONCOSEQ是为癌症患者提供的首个综合临床测序程序之一。
NATURE杂志上刊登的病例涵盖了超过30种类型的肿瘤以及在22个不同的器官中的转移，只涉及患实体瘤的成年人，然而Mi-ONCOSEQ体系也适用于患有血液肿瘤的儿童患者。
转移灶活检是关键
研究人员发现，与原发性肿瘤相比，患者转移灶肿瘤突变的数量和类型显著增加，几乎每一例转移性肿瘤都携带更多的突变。这也反映出转移性肿瘤更具侵袭性：他们有更多的时间形成额外的突变，且旨在杀死肿瘤细胞的治疗方法也可能引起更多的突变。
密歇根病理转化中心主任、高级研究人员Arul Chinnaiyan博士表示，“我们的研究结果强调了对转移性肿瘤进行新鲜活检的重要性，因为肿瘤处在一个不断发展和治疗的过程中，我们需要对转移性肿瘤进行活检，并有针对性地提出治疗方法，而不是根据原发性肿瘤的组织标本进行研究。”
RNA测序揭示更多的靶点
另一个研究的关键就是对RNA以及DNA进行测序。这种更广泛的方法揭示了许多在肿瘤微环境中发挥作用，促进和允许肿瘤细胞继续生长、扩散或逃避治疗的分子等。
通常，大多数临床测序工作仅关注DNA测序。虽然DNA测序揭示了转移性肿瘤相关的遗传改变，但研究人员发现RNA测序能够揭示可能导致致癌基因开启或者抑癌基因关闭的相关机制，并帮助确定潜在的治疗靶标。
此外，通过观察RNA，研究人员还可以检测肿瘤微环境中的免疫细胞，这也提供了一些免疫治疗敏感性相关的线索。
另一个关键发现是，转移性肿瘤表现出了两种不同的突变特征。一种是高度增殖，即肿瘤细胞快速增长；另一种是细胞失去分化能力，即上皮至间质转化。
Chinnaiyan博士认为，“不是所有的转移性肿瘤都是一样的，不同的信号驱动通路决定了某些转移肿瘤表现为高度增殖突变，而某些则更倾向于分化突变。这是一个非常重要的发现，有助于指导我们开发新的肿瘤治疗方法。”
转移性肿瘤患者携带遗传突变的比例更高
该研究另一个引人注目的发现是，12％的转移性肿瘤患者存在遗传突变，这大约是所有肿瘤患者的四倍，通过比较肿瘤DNA与正常DNA能够鉴定出这些突变。这些突变中有四分之三与DNA修复过程有关，其中几种存在针对性的靶向治疗方法。
转移性肿瘤中遗传突变的百分比很高，一旦发现这些突变，那么家庭中的其他成员也可能携带该基因，且患癌症的风险更高。因此如果条件合适的话，建议家族成员寻求遗传咨询或进一步的筛查，Mi-ONCOSEQ项目中的患者都接受了遗传咨询，并且在具有遗传突变的情况下将被扩展到其家属。
研究人员目前正在分析这些初始患者病例的结果，今年早些时候在美国临床肿瘤学会年会上提供的初步数据表明，四分之三的肿瘤患者被检测出具有“可操作突变”，意味着存在靶向这些突变的治疗方法，迄今已有近2，300名患者参加了Mi-ONCOSEQ项目。
文献来源：Integrative clinical genomics of metastatic cancer.Nature， 2017; DOI: 10.1038/nature23306
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